Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV9

RHOXF1, Rhox homeobox family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF1Q8NHV9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOXF1Q8NHV9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOXF1Q8NHV9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOXF1Q8NHV9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOXF1Q8NHV9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOXF1Q8NHV9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOXF1Q8NHV9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOXF1Q8NHV9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOXF1Q8NHV9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOXF1Q8NHV9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOXF1Q8NHV9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOXF1Q8NHV9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RHOXF1Q8NHV9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOXF1Q8NHV9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOXF1Q8NHV9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOXF1Q8NHV9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOXF1Q8NHV9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOXF1Q8NHV9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOXF1Q8NHV9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOXF1Q8NHV9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOXF1Q8NHV9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOXF1Q8NHV9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOXF1Q8NHV9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOXF1Q8NHV9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOXF1Q8NHV9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOXF1Q8NHV9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOXF1Q8NHV9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOXF1Q8NHV9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOXF1Q8NHV9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOXF1Q8NHV9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOXF1Q8NHV9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOXF1Q8NHV9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOXF1Q8NHV9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOXF1Q8NHV9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOXF1Q8NHV9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOXF1Q8NHV9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOXF1Q8NHV9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOXF1Q8NHV9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOXF1Q8NHV9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOXF1Q8NHV9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOXF1Q8NHV9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOXF1Q8NHV9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOXF1Q8NHV9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOXF1Q8NHV9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOXF1Q8NHV9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOXF1Q8NHV9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOXF1Q8NHV9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOXF1Q8NHV9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOXF1Q8NHV9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RHOXF1Q8NHV9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RHOXF1Q8NHV9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOXF1Q8NHV9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOXF1Q8NHV9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOXF1Q8NHV9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOXF1Q8NHV9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOXF1Q8NHV9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOXF1Q8NHV9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOXF1Q8NHV9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOXF1Q8NHV9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOXF1Q8NHV9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOXF1Q8NHV9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF1Q8NHV9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF1Q8NHV9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF1Q8NHV9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF1Q8NHV9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF1Q8NHV9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF1Q8NHV9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF1Q8NHV9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF1Q8NHV9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF1Q8NHV9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOXF1Q8NHV9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOXF1Q8NHV9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOXF1Q8NHV9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOXF1Q8NHV9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOXF1Q8NHV9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOXF1Q8NHV9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOXF1Q8NHV9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOXF1Q8NHV9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOXF1Q8NHV9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOXF1Q8NHV9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOXF1Q8NHV9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF1Q8NHV9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF1Q8NHV9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF1Q8NHV9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF1Q8NHV9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOXF1Q8NHV9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms