Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP35Q8NFH5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP35Q8NFH5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms