Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF397Q8NF99 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF397Q8NF99 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF397Q8NF99 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF397Q8NF99 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF397Q8NF99 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF397Q8NF99 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF397Q8NF99 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF397Q8NF99 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF397Q8NF99 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF397Q8NF99 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF397Q8NF99 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF397Q8NF99 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF397Q8NF99 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF397Q8NF99 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF397Q8NF99 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF397Q8NF99 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF397Q8NF99 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF397Q8NF99 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF397Q8NF99 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF397Q8NF99 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF397Q8NF99 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF397Q8NF99 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF397Q8NF99 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF397Q8NF99 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF397Q8NF99 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF397Q8NF99 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF397Q8NF99 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF397Q8NF99 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF397Q8NF99 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF397Q8NF99 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF397Q8NF99 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF397Q8NF99 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF397Q8NF99 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF397Q8NF99 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF397Q8NF99 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF397Q8NF99 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF397Q8NF99 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF397Q8NF99 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms