Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTD1Q8N815 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTD1Q8N815 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTD1Q8N815 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTD1Q8N815 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTD1Q8N815 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTD1Q8N815 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTD1Q8N815 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTD1Q8N815 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTD1Q8N815 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTD1Q8N815 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTD1Q8N815 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTD1Q8N815 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTD1Q8N815 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTD1Q8N815 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTD1Q8N815 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTD1Q8N815 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTD1Q8N815 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTD1Q8N815 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTD1Q8N815 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTD1Q8N815 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTD1Q8N815 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTD1Q8N815 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTD1Q8N815 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTD1Q8N815 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTD1Q8N815 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTD1Q8N815 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTD1Q8N815 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTD1Q8N815 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTD1Q8N815 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTD1Q8N815 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNTD1Q8N815 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNTD1Q8N815 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTD1Q8N815 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms