Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7H5

PAF1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAF1Q8N7H5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAF1Q8N7H5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAF1Q8N7H5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAF1Q8N7H5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAF1Q8N7H5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAF1Q8N7H5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAF1Q8N7H5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAF1Q8N7H5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAF1Q8N7H5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAF1Q8N7H5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAF1Q8N7H5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAF1Q8N7H5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PAF1Q8N7H5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAF1Q8N7H5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAF1Q8N7H5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAF1Q8N7H5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAF1Q8N7H5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAF1Q8N7H5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PAF1Q8N7H5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PAF1Q8N7H5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAF1Q8N7H5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAF1Q8N7H5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAF1Q8N7H5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAF1Q8N7H5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAF1Q8N7H5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAF1Q8N7H5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAF1Q8N7H5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAF1Q8N7H5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAF1Q8N7H5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAF1Q8N7H5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAF1Q8N7H5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAF1Q8N7H5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PAF1Q8N7H5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PAF1Q8N7H5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PAF1Q8N7H5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAF1Q8N7H5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms