Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC17Q8N6Y2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC17Q8N6Y2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC17Q8N6Y2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC17Q8N6Y2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC17Q8N6Y2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC17Q8N6Y2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC17Q8N6Y2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC17Q8N6Y2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC17Q8N6Y2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC17Q8N6Y2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms