Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJD3Q8N144 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GJD3Q8N144 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD3Q8N144 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD3Q8N144 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD3Q8N144 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD3Q8N144 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD3Q8N144 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD3Q8N144 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD3Q8N144 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD3Q8N144 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD3Q8N144 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJD3Q8N144 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJD3Q8N144 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJD3Q8N144 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJD3Q8N144 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJD3Q8N144 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJD3Q8N144 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJD3Q8N144 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJD3Q8N144 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJD3Q8N144 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJD3Q8N144 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJD3Q8N144 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJD3Q8N144 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GJD3Q8N144 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJD3Q8N144 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJD3Q8N144 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJD3Q8N144 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJD3Q8N144 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJD3Q8N144 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJD3Q8N144 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJD3Q8N144 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJD3Q8N144 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJD3Q8N144 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GJD3Q8N144 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJD3Q8N144 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJD3Q8N144 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJD3Q8N144 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJD3Q8N144 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJD3Q8N144 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJD3Q8N144 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GJD3Q8N144 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJD3Q8N144 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GJD3Q8N144 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJD3Q8N144 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJD3Q8N144 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJD3Q8N144 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJD3Q8N144 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJD3Q8N144 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJD3Q8N144 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GJD3Q8N144 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJD3Q8N144 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJD3Q8N144 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GJD3Q8N144 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GJD3Q8N144 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJD3Q8N144 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJD3Q8N144 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJD3Q8N144 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJD3Q8N144 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJD3Q8N144 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJD3Q8N144 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJD3Q8N144 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJD3Q8N144 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJD3Q8N144 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJD3Q8N144 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJD3Q8N144 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJD3Q8N144 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJD3Q8N144 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJD3Q8N144 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJD3Q8N144 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GJD3Q8N144 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJD3Q8N144 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJD3Q8N144 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJD3Q8N144 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJD3Q8N144 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJD3Q8N144 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GJD3Q8N144 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD3Q8N144 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD3Q8N144 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD3Q8N144 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD3Q8N144 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD3Q8N144 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD3Q8N144 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD3Q8N144 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD3Q8N144 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJD3Q8N144 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJD3Q8N144 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJD3Q8N144 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJD3Q8N144 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD3Q8N144 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD3Q8N144 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD3Q8N144 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD3Q8N144 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD3Q8N144 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD3Q8N144 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD3Q8N144 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD3Q8N144 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD3Q8N144 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD3Q8N144 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJD3Q8N144 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms