Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0W4

NLGN4X, Neuroligin-4, X-linked, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4XQ8N0W4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NLGN4XQ8N0W4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLGN4XQ8N0W4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLGN4XQ8N0W4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NLGN4XQ8N0W4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLGN4XQ8N0W4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLGN4XQ8N0W4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLGN4XQ8N0W4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLGN4XQ8N0W4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLGN4XQ8N0W4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLGN4XQ8N0W4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLGN4XQ8N0W4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLGN4XQ8N0W4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLGN4XQ8N0W4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLGN4XQ8N0W4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLGN4XQ8N0W4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLGN4XQ8N0W4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLGN4XQ8N0W4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLGN4XQ8N0W4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLGN4XQ8N0W4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLGN4XQ8N0W4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLGN4XQ8N0W4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLGN4XQ8N0W4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLGN4XQ8N0W4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLGN4XQ8N0W4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NLGN4XQ8N0W4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLGN4XQ8N0W4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NLGN4XQ8N0W4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NLGN4XQ8N0W4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NLGN4XQ8N0W4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NLGN4XQ8N0W4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLGN4XQ8N0W4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLGN4XQ8N0W4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLGN4XQ8N0W4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLGN4XQ8N0W4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLGN4XQ8N0W4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLGN4XQ8N0W4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLGN4XQ8N0W4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLGN4XQ8N0W4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLGN4XQ8N0W4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLGN4XQ8N0W4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLGN4XQ8N0W4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLGN4XQ8N0W4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLGN4XQ8N0W4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLGN4XQ8N0W4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLGN4XQ8N0W4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NLGN4XQ8N0W4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLGN4XQ8N0W4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLGN4XQ8N0W4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLGN4XQ8N0W4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NLGN4XQ8N0W4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NLGN4XQ8N0W4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLGN4XQ8N0W4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLGN4XQ8N0W4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLGN4XQ8N0W4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLGN4XQ8N0W4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLGN4XQ8N0W4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLGN4XQ8N0W4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.6 ms