Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM8

SLC22A9, Solute carrier family 22 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A9Q8IVM8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC22A9Q8IVM8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC22A9Q8IVM8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC22A9Q8IVM8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC22A9Q8IVM8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC22A9Q8IVM8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC22A9Q8IVM8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC22A9Q8IVM8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC22A9Q8IVM8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC22A9Q8IVM8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC22A9Q8IVM8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC22A9Q8IVM8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC22A9Q8IVM8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC22A9Q8IVM8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC22A9Q8IVM8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC22A9Q8IVM8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC22A9Q8IVM8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC22A9Q8IVM8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC22A9Q8IVM8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A9Q8IVM8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A9Q8IVM8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC22A9Q8IVM8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC22A9Q8IVM8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC22A9Q8IVM8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC22A9Q8IVM8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A9Q8IVM8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A9Q8IVM8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A9Q8IVM8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A9Q8IVM8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A9Q8IVM8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A9Q8IVM8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A9Q8IVM8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A9Q8IVM8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A9Q8IVM8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A9Q8IVM8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC22A9Q8IVM8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC22A9Q8IVM8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC22A9Q8IVM8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC22A9Q8IVM8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC22A9Q8IVM8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC22A9Q8IVM8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC22A9Q8IVM8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC22A9Q8IVM8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC22A9Q8IVM8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC22A9Q8IVM8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC22A9Q8IVM8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC22A9Q8IVM8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC22A9Q8IVM8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC22A9Q8IVM8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC22A9Q8IVM8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC22A9Q8IVM8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC22A9Q8IVM8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC22A9Q8IVM8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC22A9Q8IVM8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC22A9Q8IVM8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC22A9Q8IVM8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms