Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX29P2Q8IUI4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX29P2Q8IUI4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.9 ms