Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCNMB4Q86W47 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNMB4Q86W47 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNMB4Q86W47 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNMB4Q86W47 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNMB4Q86W47 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNMB4Q86W47 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNMB4Q86W47 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNMB4Q86W47 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNMB4Q86W47 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNMB4Q86W47 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNMB4Q86W47 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNMB4Q86W47 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNMB4Q86W47 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNMB4Q86W47 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNMB4Q86W47 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNMB4Q86W47 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNMB4Q86W47 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNMB4Q86W47 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNMB4Q86W47 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNMB4Q86W47 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNMB4Q86W47 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNMB4Q86W47 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNMB4Q86W47 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNMB4Q86W47 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNMB4Q86W47 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNMB4Q86W47 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNMB4Q86W47 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNMB4Q86W47 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNMB4Q86W47 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNMB4Q86W47 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNMB4Q86W47 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNMB4Q86W47 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNMB4Q86W47 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNMB4Q86W47 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNMB4Q86W47 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNMB4Q86W47 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNMB4Q86W47 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNMB4Q86W47 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNMB4Q86W47 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNMB4Q86W47 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNMB4Q86W47 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNMB4Q86W47 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNMB4Q86W47 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNMB4Q86W47 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNMB4Q86W47 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNMB4Q86W47 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KCNMB4Q86W47 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KCNMB4Q86W47 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNMB4Q86W47 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNMB4Q86W47 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNMB4Q86W47 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNMB4Q86W47 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNMB4Q86W47 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNMB4Q86W47 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNMB4Q86W47 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNMB4Q86W47 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNMB4Q86W47 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNMB4Q86W47 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNMB4Q86W47 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNMB4Q86W47 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNMB4Q86W47 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms