Protein–RNA interactions for Protein: Q86VP3

PACS2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2Q86VP3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PACS2Q86VP3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PACS2Q86VP3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PACS2Q86VP3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PACS2Q86VP3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PACS2Q86VP3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms