Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
PBRM1Q86U86 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
PBRM1Q86U86 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
PBRM1Q86U86 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
PBRM1Q86U86 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
PBRM1Q86U86 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
PBRM1Q86U86 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.03
PBRM1Q86U86 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
PBRM1Q86U86 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
PBRM1Q86U86 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC40.25■■■■■ 4.03
PBRM1Q86U86 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
PBRM1Q86U86 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
PBRM1Q86U86 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
PBRM1Q86U86 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
PBRM1Q86U86 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
PBRM1Q86U86 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
PBRM1Q86U86 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
PBRM1Q86U86 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
PBRM1Q86U86 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
PBRM1Q86U86 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
PBRM1Q86U86 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC40.22■■■■■ 4.03
PBRM1Q86U86 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
PBRM1Q86U86 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
PBRM1Q86U86 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
PBRM1Q86U86 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
PBRM1Q86U86 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
PBRM1Q86U86 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
PBRM1Q86U86 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC40.21■■■■■ 4.03
PBRM1Q86U86 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
PBRM1Q86U86 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
PBRM1Q86U86 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
PBRM1Q86U86 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
PBRM1Q86U86 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
PBRM1Q86U86 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
PBRM1Q86U86 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
PBRM1Q86U86 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
PBRM1Q86U86 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
PBRM1Q86U86 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
PBRM1Q86U86 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
PBRM1Q86U86 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
PBRM1Q86U86 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
PBRM1Q86U86 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
PBRM1Q86U86 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
PBRM1Q86U86 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
PBRM1Q86U86 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
PBRM1Q86U86 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
PBRM1Q86U86 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
PBRM1Q86U86 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
PBRM1Q86U86 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
PBRM1Q86U86 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
PBRM1Q86U86 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
PBRM1Q86U86 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC40.14■■■■■ 4.02
PBRM1Q86U86 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.01
PBRM1Q86U86 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
PBRM1Q86U86 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
PBRM1Q86U86 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
PBRM1Q86U86 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
PBRM1Q86U86 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
PBRM1Q86U86 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
PBRM1Q86U86 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
PBRM1Q86U86 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC40.12■■■■■ 4.01
PBRM1Q86U86 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
PBRM1Q86U86 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
PBRM1Q86U86 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
PBRM1Q86U86 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
PBRM1Q86U86 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
PBRM1Q86U86 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
PBRM1Q86U86 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
PBRM1Q86U86 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
PBRM1Q86U86 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
PBRM1Q86U86 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
PBRM1Q86U86 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
PBRM1Q86U86 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
PBRM1Q86U86 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
PBRM1Q86U86 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
PBRM1Q86U86 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC40.08■■■■■ 4.01
PBRM1Q86U86 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
PBRM1Q86U86 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
PBRM1Q86U86 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4
PBRM1Q86U86 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
PBRM1Q86U86 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
PBRM1Q86U86 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
PBRM1Q86U86 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
PBRM1Q86U86 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
PBRM1Q86U86 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
PBRM1Q86U86 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
PBRM1Q86U86 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC40.05■■■■■ 4
PBRM1Q86U86 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
PBRM1Q86U86 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
PBRM1Q86U86 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC40.05■■■■■ 4
PBRM1Q86U86 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
PBRM1Q86U86 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
PBRM1Q86U86 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
PBRM1Q86U86 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
PBRM1Q86U86 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
PBRM1Q86U86 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC40.02■■■■■ 4
PBRM1Q86U86 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
PBRM1Q86U86 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
PBRM1Q86U86 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
PBRM1Q86U86 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms