Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NPM2Q86SE8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NPM2Q86SE8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NPM2Q86SE8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NPM2Q86SE8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NPM2Q86SE8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NPM2Q86SE8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NPM2Q86SE8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NPM2Q86SE8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NPM2Q86SE8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NPM2Q86SE8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NPM2Q86SE8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NPM2Q86SE8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NPM2Q86SE8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NPM2Q86SE8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NPM2Q86SE8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NPM2Q86SE8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NPM2Q86SE8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NPM2Q86SE8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NPM2Q86SE8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NPM2Q86SE8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NPM2Q86SE8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NPM2Q86SE8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NPM2Q86SE8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NPM2Q86SE8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NPM2Q86SE8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NPM2Q86SE8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
NPM2Q86SE8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NPM2Q86SE8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NPM2Q86SE8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NPM2Q86SE8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NPM2Q86SE8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NPM2Q86SE8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NPM2Q86SE8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NPM2Q86SE8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NPM2Q86SE8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NPM2Q86SE8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NPM2Q86SE8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NPM2Q86SE8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NPM2Q86SE8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NPM2Q86SE8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NPM2Q86SE8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NPM2Q86SE8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NPM2Q86SE8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NPM2Q86SE8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NPM2Q86SE8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NPM2Q86SE8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
NPM2Q86SE8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NPM2Q86SE8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NPM2Q86SE8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NPM2Q86SE8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NPM2Q86SE8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NPM2Q86SE8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NPM2Q86SE8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
NPM2Q86SE8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NPM2Q86SE8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NPM2Q86SE8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NPM2Q86SE8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NPM2Q86SE8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NPM2Q86SE8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NPM2Q86SE8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NPM2Q86SE8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NPM2Q86SE8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NPM2Q86SE8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NPM2Q86SE8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NPM2Q86SE8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NPM2Q86SE8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NPM2Q86SE8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NPM2Q86SE8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NPM2Q86SE8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NPM2Q86SE8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NPM2Q86SE8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NPM2Q86SE8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NPM2Q86SE8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NPM2Q86SE8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NPM2Q86SE8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NPM2Q86SE8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NPM2Q86SE8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NPM2Q86SE8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NPM2Q86SE8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NPM2Q86SE8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
NPM2Q86SE8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NPM2Q86SE8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms