Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CMC1Q7Z7K0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CMC1Q7Z7K0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CMC1Q7Z7K0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CMC1Q7Z7K0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CMC1Q7Z7K0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CMC1Q7Z7K0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CMC1Q7Z7K0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CMC1Q7Z7K0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CMC1Q7Z7K0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CMC1Q7Z7K0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CMC1Q7Z7K0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CMC1Q7Z7K0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CMC1Q7Z7K0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CMC1Q7Z7K0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CMC1Q7Z7K0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CMC1Q7Z7K0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CMC1Q7Z7K0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CMC1Q7Z7K0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CMC1Q7Z7K0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CMC1Q7Z7K0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CMC1Q7Z7K0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CMC1Q7Z7K0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CMC1Q7Z7K0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CMC1Q7Z7K0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CMC1Q7Z7K0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CMC1Q7Z7K0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CMC1Q7Z7K0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CMC1Q7Z7K0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CMC1Q7Z7K0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CMC1Q7Z7K0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CMC1Q7Z7K0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CMC1Q7Z7K0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CMC1Q7Z7K0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CMC1Q7Z7K0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CMC1Q7Z7K0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CMC1Q7Z7K0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CMC1Q7Z7K0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CMC1Q7Z7K0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CMC1Q7Z7K0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CMC1Q7Z7K0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CMC1Q7Z7K0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CMC1Q7Z7K0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CMC1Q7Z7K0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CMC1Q7Z7K0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CMC1Q7Z7K0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CMC1Q7Z7K0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CMC1Q7Z7K0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CMC1Q7Z7K0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CMC1Q7Z7K0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CMC1Q7Z7K0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CMC1Q7Z7K0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CMC1Q7Z7K0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms