Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z478

DHX29, ATP-dependent RNA helicase DHX29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX29Q7Z478 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
DHX29Q7Z478 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
DHX29Q7Z478 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
DHX29Q7Z478 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC36.26■■■■□ 3.39
DHX29Q7Z478 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
DHX29Q7Z478 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
DHX29Q7Z478 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
DHX29Q7Z478 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
DHX29Q7Z478 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
DHX29Q7Z478 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
DHX29Q7Z478 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
DHX29Q7Z478 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
DHX29Q7Z478 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
DHX29Q7Z478 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
DHX29Q7Z478 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
DHX29Q7Z478 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
DHX29Q7Z478 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
DHX29Q7Z478 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
DHX29Q7Z478 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
DHX29Q7Z478 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
DHX29Q7Z478 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
DHX29Q7Z478 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
DHX29Q7Z478 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
DHX29Q7Z478 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
DHX29Q7Z478 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
DHX29Q7Z478 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
DHX29Q7Z478 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
DHX29Q7Z478 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
DHX29Q7Z478 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
DHX29Q7Z478 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
DHX29Q7Z478 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
DHX29Q7Z478 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
DHX29Q7Z478 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
DHX29Q7Z478 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
DHX29Q7Z478 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
DHX29Q7Z478 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
DHX29Q7Z478 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
DHX29Q7Z478 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
DHX29Q7Z478 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
DHX29Q7Z478 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
DHX29Q7Z478 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
DHX29Q7Z478 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
DHX29Q7Z478 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC36.15■■■■□ 3.38
DHX29Q7Z478 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
DHX29Q7Z478 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
DHX29Q7Z478 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
DHX29Q7Z478 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
DHX29Q7Z478 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
DHX29Q7Z478 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
DHX29Q7Z478 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
DHX29Q7Z478 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
DHX29Q7Z478 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
DHX29Q7Z478 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
DHX29Q7Z478 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
DHX29Q7Z478 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
DHX29Q7Z478 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
DHX29Q7Z478 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
DHX29Q7Z478 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
DHX29Q7Z478 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
DHX29Q7Z478 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
DHX29Q7Z478 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
DHX29Q7Z478 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
DHX29Q7Z478 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
DHX29Q7Z478 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
DHX29Q7Z478 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
DHX29Q7Z478 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
DHX29Q7Z478 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
DHX29Q7Z478 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
DHX29Q7Z478 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
DHX29Q7Z478 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
DHX29Q7Z478 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
DHX29Q7Z478 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC36.07■■■■□ 3.36
DHX29Q7Z478 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
DHX29Q7Z478 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
DHX29Q7Z478 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
DHX29Q7Z478 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
DHX29Q7Z478 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
DHX29Q7Z478 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
DHX29Q7Z478 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
DHX29Q7Z478 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC36.06■■■■□ 3.36
DHX29Q7Z478 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
DHX29Q7Z478 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
DHX29Q7Z478 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
DHX29Q7Z478 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
DHX29Q7Z478 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
DHX29Q7Z478 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
DHX29Q7Z478 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
DHX29Q7Z478 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
DHX29Q7Z478 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
DHX29Q7Z478 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
DHX29Q7Z478 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
DHX29Q7Z478 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
DHX29Q7Z478 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
DHX29Q7Z478 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
DHX29Q7Z478 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
DHX29Q7Z478 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC36.02■■■■□ 3.36
DHX29Q7Z478 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
DHX29Q7Z478 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
DHX29Q7Z478 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
DHX29Q7Z478 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms