Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATG9AQ7Z3C6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATG9AQ7Z3C6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATG9AQ7Z3C6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ATG9AQ7Z3C6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATG9AQ7Z3C6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATG9AQ7Z3C6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
ATG9AQ7Z3C6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
ATG9AQ7Z3C6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATG9AQ7Z3C6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATG9AQ7Z3C6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATG9AQ7Z3C6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATG9AQ7Z3C6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ATG9AQ7Z3C6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATG9AQ7Z3C6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATG9AQ7Z3C6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATG9AQ7Z3C6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATG9AQ7Z3C6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATG9AQ7Z3C6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATG9AQ7Z3C6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATG9AQ7Z3C6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATG9AQ7Z3C6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATG9AQ7Z3C6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATG9AQ7Z3C6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATG9AQ7Z3C6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATG9AQ7Z3C6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATG9AQ7Z3C6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATG9AQ7Z3C6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATG9AQ7Z3C6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATG9AQ7Z3C6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATG9AQ7Z3C6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATG9AQ7Z3C6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATG9AQ7Z3C6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ATG9AQ7Z3C6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ATG9AQ7Z3C6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ATG9AQ7Z3C6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATG9AQ7Z3C6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATG9AQ7Z3C6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATG9AQ7Z3C6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATG9AQ7Z3C6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
ATG9AQ7Z3C6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATG9AQ7Z3C6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATG9AQ7Z3C6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATG9AQ7Z3C6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATG9AQ7Z3C6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATG9AQ7Z3C6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATG9AQ7Z3C6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATG9AQ7Z3C6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATG9AQ7Z3C6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATG9AQ7Z3C6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATG9AQ7Z3C6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATG9AQ7Z3C6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ATG9AQ7Z3C6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATG9AQ7Z3C6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATG9AQ7Z3C6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATG9AQ7Z3C6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
ATG9AQ7Z3C6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATG9AQ7Z3C6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATG9AQ7Z3C6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATG9AQ7Z3C6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATG9AQ7Z3C6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATG9AQ7Z3C6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATG9AQ7Z3C6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
ATG9AQ7Z3C6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATG9AQ7Z3C6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATG9AQ7Z3C6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ATG9AQ7Z3C6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATG9AQ7Z3C6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATG9AQ7Z3C6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATG9AQ7Z3C6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATG9AQ7Z3C6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATG9AQ7Z3C6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ATG9AQ7Z3C6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ATG9AQ7Z3C6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATG9AQ7Z3C6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATG9AQ7Z3C6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATG9AQ7Z3C6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATG9AQ7Z3C6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATG9AQ7Z3C6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATG9AQ7Z3C6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATG9AQ7Z3C6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATG9AQ7Z3C6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATG9AQ7Z3C6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATG9AQ7Z3C6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATG9AQ7Z3C6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATG9AQ7Z3C6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATG9AQ7Z3C6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATG9AQ7Z3C6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATG9AQ7Z3C6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATG9AQ7Z3C6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATG9AQ7Z3C6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATG9AQ7Z3C6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATG9AQ7Z3C6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms