Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTY1

SLC16A9, Monocarboxylate transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A9Q7RTY1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC16A9Q7RTY1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC16A9Q7RTY1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC16A9Q7RTY1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC16A9Q7RTY1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC16A9Q7RTY1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC16A9Q7RTY1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC16A9Q7RTY1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC16A9Q7RTY1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC16A9Q7RTY1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC16A9Q7RTY1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC16A9Q7RTY1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC16A9Q7RTY1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC16A9Q7RTY1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC16A9Q7RTY1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC16A9Q7RTY1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms