Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP9Q7RTR0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP9Q7RTR0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP9Q7RTR0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP9Q7RTR0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP9Q7RTR0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP9Q7RTR0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP9Q7RTR0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP9Q7RTR0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP9Q7RTR0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP9Q7RTR0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP9Q7RTR0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP9Q7RTR0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP9Q7RTR0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP9Q7RTR0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP9Q7RTR0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP9Q7RTR0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP9Q7RTR0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP9Q7RTR0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP9Q7RTR0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP9Q7RTR0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP9Q7RTR0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP9Q7RTR0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP9Q7RTR0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP9Q7RTR0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP9Q7RTR0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLRP9Q7RTR0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms