Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM47EQ6ZV65 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM47EQ6ZV65 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM47EQ6ZV65 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM47EQ6ZV65 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM47EQ6ZV65 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM47EQ6ZV65 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM47EQ6ZV65 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM47EQ6ZV65 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM47EQ6ZV65 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM47EQ6ZV65 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM47EQ6ZV65 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM47EQ6ZV65 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM47EQ6ZV65 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM47EQ6ZV65 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM47EQ6ZV65 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM47EQ6ZV65 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM47EQ6ZV65 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM47EQ6ZV65 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM47EQ6ZV65 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM47EQ6ZV65 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM47EQ6ZV65 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM47EQ6ZV65 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM47EQ6ZV65 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM47EQ6ZV65 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM47EQ6ZV65 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM47EQ6ZV65 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM47EQ6ZV65 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM47EQ6ZV65 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM47EQ6ZV65 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM47EQ6ZV65 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM47EQ6ZV65 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM47EQ6ZV65 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM47EQ6ZV65 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM47EQ6ZV65 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms