Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM136Q6ZRR5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMEM136Q6ZRR5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM136Q6ZRR5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms