Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 398.2 ms