Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L8

SHC4, SHC-transforming protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC4Q6S5L8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHC4Q6S5L8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHC4Q6S5L8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHC4Q6S5L8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHC4Q6S5L8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHC4Q6S5L8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHC4Q6S5L8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHC4Q6S5L8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHC4Q6S5L8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHC4Q6S5L8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHC4Q6S5L8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SHC4Q6S5L8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHC4Q6S5L8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SHC4Q6S5L8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHC4Q6S5L8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SHC4Q6S5L8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHC4Q6S5L8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHC4Q6S5L8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHC4Q6S5L8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHC4Q6S5L8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHC4Q6S5L8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHC4Q6S5L8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHC4Q6S5L8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SHC4Q6S5L8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SHC4Q6S5L8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SHC4Q6S5L8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHC4Q6S5L8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHC4Q6S5L8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHC4Q6S5L8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHC4Q6S5L8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHC4Q6S5L8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHC4Q6S5L8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SHC4Q6S5L8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SHC4Q6S5L8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHC4Q6S5L8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHC4Q6S5L8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHC4Q6S5L8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHC4Q6S5L8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SHC4Q6S5L8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHC4Q6S5L8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHC4Q6S5L8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHC4Q6S5L8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHC4Q6S5L8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHC4Q6S5L8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHC4Q6S5L8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHC4Q6S5L8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHC4Q6S5L8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHC4Q6S5L8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SHC4Q6S5L8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHC4Q6S5L8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHC4Q6S5L8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHC4Q6S5L8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHC4Q6S5L8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHC4Q6S5L8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SHC4Q6S5L8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SHC4Q6S5L8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SHC4Q6S5L8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SHC4Q6S5L8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SHC4Q6S5L8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHC4Q6S5L8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHC4Q6S5L8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SHC4Q6S5L8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SHC4Q6S5L8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHC4Q6S5L8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHC4Q6S5L8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHC4Q6S5L8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHC4Q6S5L8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SHC4Q6S5L8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHC4Q6S5L8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHC4Q6S5L8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHC4Q6S5L8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHC4Q6S5L8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHC4Q6S5L8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHC4Q6S5L8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHC4Q6S5L8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHC4Q6S5L8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHC4Q6S5L8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SHC4Q6S5L8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHC4Q6S5L8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHC4Q6S5L8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHC4Q6S5L8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHC4Q6S5L8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHC4Q6S5L8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHC4Q6S5L8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHC4Q6S5L8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHC4Q6S5L8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHC4Q6S5L8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHC4Q6S5L8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SHC4Q6S5L8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHC4Q6S5L8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHC4Q6S5L8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHC4Q6S5L8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHC4Q6S5L8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHC4Q6S5L8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHC4Q6S5L8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SHC4Q6S5L8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHC4Q6S5L8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHC4Q6S5L8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHC4Q6S5L8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHC4Q6S5L8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms