Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUI8

C19orf48, Uncharacterized protein C19orf48, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf48Q6RUI8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C19orf48Q6RUI8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C19orf48Q6RUI8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms