Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
ZBED9Q6R2W3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ZBED9Q6R2W3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ZBED9Q6R2W3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ZBED9Q6R2W3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ZBED9Q6R2W3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ZBED9Q6R2W3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
ZBED9Q6R2W3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
ZBED9Q6R2W3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
ZBED9Q6R2W3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
ZBED9Q6R2W3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
ZBED9Q6R2W3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
ZBED9Q6R2W3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
ZBED9Q6R2W3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
ZBED9Q6R2W3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
ZBED9Q6R2W3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
ZBED9Q6R2W3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
ZBED9Q6R2W3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
ZBED9Q6R2W3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
ZBED9Q6R2W3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ZBED9Q6R2W3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ZBED9Q6R2W3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ZBED9Q6R2W3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ZBED9Q6R2W3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ZBED9Q6R2W3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
ZBED9Q6R2W3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ZBED9Q6R2W3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
ZBED9Q6R2W3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ZBED9Q6R2W3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
ZBED9Q6R2W3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ZBED9Q6R2W3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
ZBED9Q6R2W3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ZBED9Q6R2W3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
ZBED9Q6R2W3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
ZBED9Q6R2W3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
ZBED9Q6R2W3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
ZBED9Q6R2W3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC31.76■■■□□ 2.67
ZBED9Q6R2W3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
ZBED9Q6R2W3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
ZBED9Q6R2W3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
ZBED9Q6R2W3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
ZBED9Q6R2W3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
ZBED9Q6R2W3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
ZBED9Q6R2W3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
ZBED9Q6R2W3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
ZBED9Q6R2W3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
ZBED9Q6R2W3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
ZBED9Q6R2W3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
ZBED9Q6R2W3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
ZBED9Q6R2W3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ZBED9Q6R2W3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
ZBED9Q6R2W3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
ZBED9Q6R2W3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
ZBED9Q6R2W3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
ZBED9Q6R2W3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.73■■■□□ 2.67
ZBED9Q6R2W3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ZBED9Q6R2W3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ZBED9Q6R2W3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
ZBED9Q6R2W3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ZBED9Q6R2W3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ZBED9Q6R2W3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ZBED9Q6R2W3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ZBED9Q6R2W3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ZBED9Q6R2W3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ZBED9Q6R2W3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
ZBED9Q6R2W3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ZBED9Q6R2W3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ZBED9Q6R2W3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ZBED9Q6R2W3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZBED9Q6R2W3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms