Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF04

ZNF613, Zinc finger protein 613, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF613Q6PF04 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF613Q6PF04 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF613Q6PF04 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF613Q6PF04 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF613Q6PF04 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF613Q6PF04 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF613Q6PF04 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF613Q6PF04 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF613Q6PF04 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF613Q6PF04 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF613Q6PF04 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF613Q6PF04 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF613Q6PF04 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF613Q6PF04 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF613Q6PF04 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF613Q6PF04 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF613Q6PF04 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF613Q6PF04 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF613Q6PF04 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF613Q6PF04 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF613Q6PF04 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF613Q6PF04 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF613Q6PF04 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF613Q6PF04 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF613Q6PF04 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF613Q6PF04 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF613Q6PF04 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF613Q6PF04 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF613Q6PF04 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF613Q6PF04 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF613Q6PF04 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms