Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZCCHC12Q6PEW1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZCCHC12Q6PEW1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.5 ms