Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKN3Q6P5Z2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKN3Q6P5Z2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKN3Q6P5Z2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKN3Q6P5Z2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKN3Q6P5Z2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKN3Q6P5Z2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKN3Q6P5Z2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKN3Q6P5Z2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PKN3Q6P5Z2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PKN3Q6P5Z2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PKN3Q6P5Z2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKN3Q6P5Z2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKN3Q6P5Z2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKN3Q6P5Z2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PKN3Q6P5Z2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKN3Q6P5Z2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PKN3Q6P5Z2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKN3Q6P5Z2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKN3Q6P5Z2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PKN3Q6P5Z2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKN3Q6P5Z2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKN3Q6P5Z2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKN3Q6P5Z2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PKN3Q6P5Z2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PKN3Q6P5Z2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKN3Q6P5Z2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKN3Q6P5Z2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKN3Q6P5Z2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKN3Q6P5Z2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKN3Q6P5Z2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKN3Q6P5Z2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKN3Q6P5Z2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKN3Q6P5Z2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKN3Q6P5Z2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKN3Q6P5Z2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKN3Q6P5Z2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PKN3Q6P5Z2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKN3Q6P5Z2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PKN3Q6P5Z2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKN3Q6P5Z2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKN3Q6P5Z2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKN3Q6P5Z2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKN3Q6P5Z2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKN3Q6P5Z2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKN3Q6P5Z2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PKN3Q6P5Z2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKN3Q6P5Z2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKN3Q6P5Z2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKN3Q6P5Z2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKN3Q6P5Z2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKN3Q6P5Z2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKN3Q6P5Z2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKN3Q6P5Z2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKN3Q6P5Z2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKN3Q6P5Z2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKN3Q6P5Z2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKN3Q6P5Z2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKN3Q6P5Z2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKN3Q6P5Z2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms