Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1K1

SLC48A1, Heme transporter HRG1, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC48A1Q6P1K1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC48A1Q6P1K1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC48A1Q6P1K1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC48A1Q6P1K1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC48A1Q6P1K1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC48A1Q6P1K1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC48A1Q6P1K1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC48A1Q6P1K1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC48A1Q6P1K1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC48A1Q6P1K1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC48A1Q6P1K1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC48A1Q6P1K1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC48A1Q6P1K1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC48A1Q6P1K1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC48A1Q6P1K1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC48A1Q6P1K1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC48A1Q6P1K1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC48A1Q6P1K1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms