Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RCSD1Q6JBY9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RCSD1Q6JBY9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RCSD1Q6JBY9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RCSD1Q6JBY9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RCSD1Q6JBY9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RCSD1Q6JBY9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RCSD1Q6JBY9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RCSD1Q6JBY9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RCSD1Q6JBY9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RCSD1Q6JBY9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RCSD1Q6JBY9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RCSD1Q6JBY9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RCSD1Q6JBY9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RCSD1Q6JBY9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RCSD1Q6JBY9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RCSD1Q6JBY9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RCSD1Q6JBY9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RCSD1Q6JBY9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RCSD1Q6JBY9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RCSD1Q6JBY9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RCSD1Q6JBY9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RCSD1Q6JBY9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RCSD1Q6JBY9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RCSD1Q6JBY9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RCSD1Q6JBY9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RCSD1Q6JBY9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RCSD1Q6JBY9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RCSD1Q6JBY9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RCSD1Q6JBY9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RCSD1Q6JBY9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms