Protein–RNA interactions for Protein: Q6IEG0

SNRNP48, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 48 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP48Q6IEG0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNRNP48Q6IEG0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNRNP48Q6IEG0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNRNP48Q6IEG0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNRNP48Q6IEG0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNRNP48Q6IEG0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNRNP48Q6IEG0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNRNP48Q6IEG0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNRNP48Q6IEG0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNRNP48Q6IEG0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNRNP48Q6IEG0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNRNP48Q6IEG0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNRNP48Q6IEG0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNRNP48Q6IEG0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNRNP48Q6IEG0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNRNP48Q6IEG0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNRNP48Q6IEG0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNRNP48Q6IEG0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNRNP48Q6IEG0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNRNP48Q6IEG0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNRNP48Q6IEG0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNRNP48Q6IEG0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNRNP48Q6IEG0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNRNP48Q6IEG0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNRNP48Q6IEG0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNRNP48Q6IEG0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNRNP48Q6IEG0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNRNP48Q6IEG0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SNRNP48Q6IEG0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNRNP48Q6IEG0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNRNP48Q6IEG0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNRNP48Q6IEG0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNRNP48Q6IEG0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNRNP48Q6IEG0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNRNP48Q6IEG0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNRNP48Q6IEG0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNRNP48Q6IEG0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNRNP48Q6IEG0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNRNP48Q6IEG0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNRNP48Q6IEG0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNRNP48Q6IEG0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNRNP48Q6IEG0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SNRNP48Q6IEG0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SNRNP48Q6IEG0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNRNP48Q6IEG0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNRNP48Q6IEG0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNRNP48Q6IEG0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNRNP48Q6IEG0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SNRNP48Q6IEG0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNRNP48Q6IEG0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNRNP48Q6IEG0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNRNP48Q6IEG0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNRNP48Q6IEG0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNRNP48Q6IEG0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNRNP48Q6IEG0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SNRNP48Q6IEG0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNRNP48Q6IEG0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SNRNP48Q6IEG0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNRNP48Q6IEG0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNRNP48Q6IEG0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNRNP48Q6IEG0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SNRNP48Q6IEG0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNRNP48Q6IEG0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNRNP48Q6IEG0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNRNP48Q6IEG0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNRNP48Q6IEG0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNRNP48Q6IEG0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNRNP48Q6IEG0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNRNP48Q6IEG0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNRNP48Q6IEG0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNRNP48Q6IEG0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNRNP48Q6IEG0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNRNP48Q6IEG0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNRNP48Q6IEG0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SNRNP48Q6IEG0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNRNP48Q6IEG0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNRNP48Q6IEG0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNRNP48Q6IEG0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNRNP48Q6IEG0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNRNP48Q6IEG0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNRNP48Q6IEG0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNRNP48Q6IEG0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNRNP48Q6IEG0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNRNP48Q6IEG0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNRNP48Q6IEG0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SNRNP48Q6IEG0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SNRNP48Q6IEG0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SNRNP48Q6IEG0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SNRNP48Q6IEG0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SNRNP48Q6IEG0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SNRNP48Q6IEG0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SNRNP48Q6IEG0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SNRNP48Q6IEG0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SNRNP48Q6IEG0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SNRNP48Q6IEG0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SNRNP48Q6IEG0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SNRNP48Q6IEG0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SNRNP48Q6IEG0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNRNP48Q6IEG0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNRNP48Q6IEG0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms