Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCAPH2Q6IBW4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCAPH2Q6IBW4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCAPH2Q6IBW4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCAPH2Q6IBW4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCAPH2Q6IBW4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCAPH2Q6IBW4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCAPH2Q6IBW4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCAPH2Q6IBW4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCAPH2Q6IBW4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCAPH2Q6IBW4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCAPH2Q6IBW4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCAPH2Q6IBW4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCAPH2Q6IBW4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NCAPH2Q6IBW4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCAPH2Q6IBW4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCAPH2Q6IBW4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCAPH2Q6IBW4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCAPH2Q6IBW4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCAPH2Q6IBW4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCAPH2Q6IBW4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NCAPH2Q6IBW4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCAPH2Q6IBW4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCAPH2Q6IBW4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCAPH2Q6IBW4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NCAPH2Q6IBW4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCAPH2Q6IBW4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCAPH2Q6IBW4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NCAPH2Q6IBW4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NCAPH2Q6IBW4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NCAPH2Q6IBW4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCAPH2Q6IBW4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCAPH2Q6IBW4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NCAPH2Q6IBW4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCAPH2Q6IBW4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCAPH2Q6IBW4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCAPH2Q6IBW4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCAPH2Q6IBW4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCAPH2Q6IBW4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCAPH2Q6IBW4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCAPH2Q6IBW4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCAPH2Q6IBW4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NCAPH2Q6IBW4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCAPH2Q6IBW4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCAPH2Q6IBW4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCAPH2Q6IBW4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NCAPH2Q6IBW4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCAPH2Q6IBW4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCAPH2Q6IBW4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NCAPH2Q6IBW4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NCAPH2Q6IBW4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCAPH2Q6IBW4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCAPH2Q6IBW4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCAPH2Q6IBW4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCAPH2Q6IBW4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCAPH2Q6IBW4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCAPH2Q6IBW4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCAPH2Q6IBW4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCAPH2Q6IBW4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCAPH2Q6IBW4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCAPH2Q6IBW4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCAPH2Q6IBW4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NCAPH2Q6IBW4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCAPH2Q6IBW4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCAPH2Q6IBW4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCAPH2Q6IBW4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCAPH2Q6IBW4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NCAPH2Q6IBW4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCAPH2Q6IBW4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCAPH2Q6IBW4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCAPH2Q6IBW4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NCAPH2Q6IBW4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCAPH2Q6IBW4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCAPH2Q6IBW4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCAPH2Q6IBW4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCAPH2Q6IBW4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCAPH2Q6IBW4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCAPH2Q6IBW4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCAPH2Q6IBW4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCAPH2Q6IBW4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCAPH2Q6IBW4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCAPH2Q6IBW4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCAPH2Q6IBW4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCAPH2Q6IBW4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCAPH2Q6IBW4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCAPH2Q6IBW4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCAPH2Q6IBW4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCAPH2Q6IBW4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCAPH2Q6IBW4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCAPH2Q6IBW4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCAPH2Q6IBW4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCAPH2Q6IBW4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NCAPH2Q6IBW4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCAPH2Q6IBW4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCAPH2Q6IBW4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCAPH2Q6IBW4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCAPH2Q6IBW4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCAPH2Q6IBW4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCAPH2Q6IBW4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCAPH2Q6IBW4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms