Protein–RNA interactions for Protein: Q6BDI9

REP15, Rab15 effector protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REP15Q6BDI9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
REP15Q6BDI9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
REP15Q6BDI9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
REP15Q6BDI9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms