Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DUPD1Q68J44 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DUPD1Q68J44 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DUPD1Q68J44 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DUPD1Q68J44 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DUPD1Q68J44 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUPD1Q68J44 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUPD1Q68J44 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUPD1Q68J44 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUPD1Q68J44 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUPD1Q68J44 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DUPD1Q68J44 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUPD1Q68J44 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUPD1Q68J44 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUPD1Q68J44 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DUPD1Q68J44 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUPD1Q68J44 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DUPD1Q68J44 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DUPD1Q68J44 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DUPD1Q68J44 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DUPD1Q68J44 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DUPD1Q68J44 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DUPD1Q68J44 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DUPD1Q68J44 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DUPD1Q68J44 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DUPD1Q68J44 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DUPD1Q68J44 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DUPD1Q68J44 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DUPD1Q68J44 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DUPD1Q68J44 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DUPD1Q68J44 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms