Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG9BQ674R7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG9BQ674R7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG9BQ674R7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG9BQ674R7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG9BQ674R7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG9BQ674R7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG9BQ674R7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG9BQ674R7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG9BQ674R7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG9BQ674R7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG9BQ674R7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG9BQ674R7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG9BQ674R7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG9BQ674R7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG9BQ674R7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG9BQ674R7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG9BQ674R7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG9BQ674R7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG9BQ674R7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG9BQ674R7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG9BQ674R7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG9BQ674R7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG9BQ674R7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG9BQ674R7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG9BQ674R7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG9BQ674R7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG9BQ674R7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG9BQ674R7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG9BQ674R7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG9BQ674R7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG9BQ674R7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms