Protein–RNA interactions for Protein: Q643R3

LPCAT4, Lysophospholipid acyltransferase LPCAT4, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT4Q643R3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPCAT4Q643R3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms