Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLX4IPQ5VYV7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms