Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ECM29Q5VYK3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ECM29Q5VYK3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ECM29Q5VYK3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ECM29Q5VYK3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ECM29Q5VYK3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ECM29Q5VYK3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ECM29Q5VYK3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ECM29Q5VYK3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ECM29Q5VYK3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ECM29Q5VYK3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ECM29Q5VYK3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ECM29Q5VYK3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ECM29Q5VYK3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ECM29Q5VYK3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ECM29Q5VYK3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ECM29Q5VYK3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ECM29Q5VYK3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ECM29Q5VYK3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ECM29Q5VYK3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ECM29Q5VYK3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ECM29Q5VYK3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ECM29Q5VYK3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ECM29Q5VYK3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ECM29Q5VYK3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ECM29Q5VYK3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ECM29Q5VYK3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ECM29Q5VYK3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ECM29Q5VYK3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ECM29Q5VYK3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ECM29Q5VYK3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ECM29Q5VYK3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ECM29Q5VYK3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ECM29Q5VYK3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ECM29Q5VYK3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ECM29Q5VYK3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ECM29Q5VYK3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ECM29Q5VYK3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ECM29Q5VYK3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ECM29Q5VYK3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ECM29Q5VYK3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ECM29Q5VYK3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ECM29Q5VYK3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ECM29Q5VYK3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ECM29Q5VYK3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ECM29Q5VYK3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ECM29Q5VYK3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ECM29Q5VYK3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ECM29Q5VYK3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ECM29Q5VYK3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ECM29Q5VYK3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ECM29Q5VYK3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ECM29Q5VYK3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ECM29Q5VYK3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ECM29Q5VYK3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ECM29Q5VYK3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ECM29Q5VYK3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ECM29Q5VYK3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ECM29Q5VYK3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ECM29Q5VYK3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ECM29Q5VYK3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ECM29Q5VYK3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ECM29Q5VYK3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ECM29Q5VYK3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ECM29Q5VYK3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ECM29Q5VYK3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ECM29Q5VYK3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ECM29Q5VYK3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ECM29Q5VYK3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ECM29Q5VYK3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ECM29Q5VYK3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ECM29Q5VYK3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ECM29Q5VYK3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ECM29Q5VYK3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ECM29Q5VYK3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ECM29Q5VYK3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ECM29Q5VYK3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ECM29Q5VYK3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ECM29Q5VYK3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ECM29Q5VYK3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ECM29Q5VYK3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ECM29Q5VYK3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ECM29Q5VYK3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ECM29Q5VYK3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ECM29Q5VYK3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ECM29Q5VYK3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ECM29Q5VYK3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ECM29Q5VYK3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ECM29Q5VYK3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ECM29Q5VYK3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ECM29Q5VYK3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ECM29Q5VYK3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ECM29Q5VYK3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ECM29Q5VYK3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ECM29Q5VYK3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ECM29Q5VYK3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ECM29Q5VYK3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ECM29Q5VYK3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ECM29Q5VYK3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms