Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM6

PRAMEF13, Putative PRAME family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF13Q5VWM6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF13Q5VWM6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF13Q5VWM6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF13Q5VWM6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF13Q5VWM6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF13Q5VWM6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF13Q5VWM6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF13Q5VWM6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF13Q5VWM6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF13Q5VWM6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF13Q5VWM6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF13Q5VWM6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF13Q5VWM6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF13Q5VWM6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF13Q5VWM6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF13Q5VWM6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF13Q5VWM6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF13Q5VWM6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF13Q5VWM6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF13Q5VWM6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF13Q5VWM6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF13Q5VWM6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF13Q5VWM6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF13Q5VWM6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF13Q5VWM6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF13Q5VWM6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF13Q5VWM6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF13Q5VWM6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF13Q5VWM6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF13Q5VWM6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF13Q5VWM6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF13Q5VWM6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF13Q5VWM6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF13Q5VWM6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF13Q5VWM6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF13Q5VWM6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF13Q5VWM6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF13Q5VWM6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF13Q5VWM6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF13Q5VWM6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF13Q5VWM6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF13Q5VWM6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF13Q5VWM6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF13Q5VWM6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF13Q5VWM6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRAMEF13Q5VWM6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF13Q5VWM6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF13Q5VWM6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF13Q5VWM6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF13Q5VWM6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF13Q5VWM6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF13Q5VWM6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms