Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SFMBT2Q5VUG0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SFMBT2Q5VUG0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SFMBT2Q5VUG0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SFMBT2Q5VUG0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SFMBT2Q5VUG0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SFMBT2Q5VUG0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SFMBT2Q5VUG0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SFMBT2Q5VUG0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SFMBT2Q5VUG0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SFMBT2Q5VUG0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SFMBT2Q5VUG0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SFMBT2Q5VUG0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SFMBT2Q5VUG0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SFMBT2Q5VUG0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SFMBT2Q5VUG0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SFMBT2Q5VUG0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SFMBT2Q5VUG0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SFMBT2Q5VUG0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SFMBT2Q5VUG0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SFMBT2Q5VUG0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SFMBT2Q5VUG0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SFMBT2Q5VUG0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SFMBT2Q5VUG0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SFMBT2Q5VUG0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SFMBT2Q5VUG0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SFMBT2Q5VUG0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SFMBT2Q5VUG0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SFMBT2Q5VUG0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SFMBT2Q5VUG0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SFMBT2Q5VUG0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SFMBT2Q5VUG0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SFMBT2Q5VUG0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SFMBT2Q5VUG0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SFMBT2Q5VUG0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SFMBT2Q5VUG0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SFMBT2Q5VUG0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SFMBT2Q5VUG0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SFMBT2Q5VUG0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SFMBT2Q5VUG0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SFMBT2Q5VUG0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SFMBT2Q5VUG0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SFMBT2Q5VUG0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SFMBT2Q5VUG0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SFMBT2Q5VUG0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SFMBT2Q5VUG0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SFMBT2Q5VUG0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SFMBT2Q5VUG0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SFMBT2Q5VUG0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SFMBT2Q5VUG0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SFMBT2Q5VUG0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SFMBT2Q5VUG0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SFMBT2Q5VUG0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SFMBT2Q5VUG0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms