Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL7

FNDC7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC7Q5VTL7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC7Q5VTL7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC7Q5VTL7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC7Q5VTL7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC7Q5VTL7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC7Q5VTL7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC7Q5VTL7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC7Q5VTL7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC7Q5VTL7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC7Q5VTL7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC7Q5VTL7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC7Q5VTL7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC7Q5VTL7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC7Q5VTL7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC7Q5VTL7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC7Q5VTL7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FNDC7Q5VTL7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FNDC7Q5VTL7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC7Q5VTL7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC7Q5VTL7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC7Q5VTL7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC7Q5VTL7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC7Q5VTL7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC7Q5VTL7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC7Q5VTL7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC7Q5VTL7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC7Q5VTL7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC7Q5VTL7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC7Q5VTL7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC7Q5VTL7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC7Q5VTL7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC7Q5VTL7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC7Q5VTL7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC7Q5VTL7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC7Q5VTL7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC7Q5VTL7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC7Q5VTL7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC7Q5VTL7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC7Q5VTL7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC7Q5VTL7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC7Q5VTL7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC7Q5VTL7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC7Q5VTL7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC7Q5VTL7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC7Q5VTL7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC7Q5VTL7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms