Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GKAP1Q5VSY0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GKAP1Q5VSY0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GKAP1Q5VSY0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GKAP1Q5VSY0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GKAP1Q5VSY0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GKAP1Q5VSY0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GKAP1Q5VSY0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GKAP1Q5VSY0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GKAP1Q5VSY0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GKAP1Q5VSY0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GKAP1Q5VSY0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GKAP1Q5VSY0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GKAP1Q5VSY0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GKAP1Q5VSY0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GKAP1Q5VSY0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GKAP1Q5VSY0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GKAP1Q5VSY0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GKAP1Q5VSY0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GKAP1Q5VSY0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GKAP1Q5VSY0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GKAP1Q5VSY0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GKAP1Q5VSY0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GKAP1Q5VSY0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GKAP1Q5VSY0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GKAP1Q5VSY0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GKAP1Q5VSY0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GKAP1Q5VSY0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GKAP1Q5VSY0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GKAP1Q5VSY0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GKAP1Q5VSY0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GKAP1Q5VSY0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GKAP1Q5VSY0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms