Protein–RNA interactions for Protein: Q5TH69

ARFGEF3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF3Q5TH69 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARFGEF3Q5TH69 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARFGEF3Q5TH69 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARFGEF3Q5TH69 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARFGEF3Q5TH69 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARFGEF3Q5TH69 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARFGEF3Q5TH69 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARFGEF3Q5TH69 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARFGEF3Q5TH69 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARFGEF3Q5TH69 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms