Protein–RNA interactions for Protein: Q5TAT6

COL13A1, Collagen alpha-1(XIII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL13A1Q5TAT6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL13A1Q5TAT6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL13A1Q5TAT6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL13A1Q5TAT6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL13A1Q5TAT6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL13A1Q5TAT6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL13A1Q5TAT6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL13A1Q5TAT6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL13A1Q5TAT6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL13A1Q5TAT6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
COL13A1Q5TAT6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL13A1Q5TAT6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL13A1Q5TAT6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL13A1Q5TAT6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL13A1Q5TAT6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL13A1Q5TAT6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL13A1Q5TAT6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL13A1Q5TAT6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL13A1Q5TAT6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
COL13A1Q5TAT6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL13A1Q5TAT6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL13A1Q5TAT6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL13A1Q5TAT6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL13A1Q5TAT6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL13A1Q5TAT6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL13A1Q5TAT6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
COL13A1Q5TAT6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL13A1Q5TAT6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
COL13A1Q5TAT6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL13A1Q5TAT6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL13A1Q5TAT6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL13A1Q5TAT6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL13A1Q5TAT6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL13A1Q5TAT6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COL13A1Q5TAT6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
COL13A1Q5TAT6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
COL13A1Q5TAT6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL13A1Q5TAT6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
COL13A1Q5TAT6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL13A1Q5TAT6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL13A1Q5TAT6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL13A1Q5TAT6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL13A1Q5TAT6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL13A1Q5TAT6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL13A1Q5TAT6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL13A1Q5TAT6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
COL13A1Q5TAT6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL13A1Q5TAT6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL13A1Q5TAT6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL13A1Q5TAT6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL13A1Q5TAT6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL13A1Q5TAT6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL13A1Q5TAT6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL13A1Q5TAT6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL13A1Q5TAT6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL13A1Q5TAT6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL13A1Q5TAT6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
COL13A1Q5TAT6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
COL13A1Q5TAT6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL13A1Q5TAT6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL13A1Q5TAT6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL13A1Q5TAT6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL13A1Q5TAT6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL13A1Q5TAT6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL13A1Q5TAT6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
COL13A1Q5TAT6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL13A1Q5TAT6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL13A1Q5TAT6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL13A1Q5TAT6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL13A1Q5TAT6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL13A1Q5TAT6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL13A1Q5TAT6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL13A1Q5TAT6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL13A1Q5TAT6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL13A1Q5TAT6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL13A1Q5TAT6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
COL13A1Q5TAT6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
COL13A1Q5TAT6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
COL13A1Q5TAT6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL13A1Q5TAT6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL13A1Q5TAT6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL13A1Q5TAT6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL13A1Q5TAT6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL13A1Q5TAT6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL13A1Q5TAT6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL13A1Q5TAT6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL13A1Q5TAT6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL13A1Q5TAT6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL13A1Q5TAT6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
COL13A1Q5TAT6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL13A1Q5TAT6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
COL13A1Q5TAT6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL13A1Q5TAT6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL13A1Q5TAT6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL13A1Q5TAT6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
COL13A1Q5TAT6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL13A1Q5TAT6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL13A1Q5TAT6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
COL13A1Q5TAT6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL13A1Q5TAT6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms