Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC183Q5T5S1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC183Q5T5S1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC183Q5T5S1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC183Q5T5S1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC183Q5T5S1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC183Q5T5S1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC183Q5T5S1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC183Q5T5S1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC183Q5T5S1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC183Q5T5S1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC183Q5T5S1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC183Q5T5S1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC183Q5T5S1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC183Q5T5S1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC183Q5T5S1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC183Q5T5S1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC183Q5T5S1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CCDC183Q5T5S1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CCDC183Q5T5S1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC183Q5T5S1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC183Q5T5S1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC183Q5T5S1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC183Q5T5S1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC183Q5T5S1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC183Q5T5S1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC183Q5T5S1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC183Q5T5S1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC183Q5T5S1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC183Q5T5S1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC183Q5T5S1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC183Q5T5S1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC183Q5T5S1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC183Q5T5S1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC183Q5T5S1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC183Q5T5S1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC183Q5T5S1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC183Q5T5S1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC183Q5T5S1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC183Q5T5S1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC183Q5T5S1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC183Q5T5S1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC183Q5T5S1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC183Q5T5S1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC183Q5T5S1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC183Q5T5S1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC183Q5T5S1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC183Q5T5S1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC183Q5T5S1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC183Q5T5S1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC183Q5T5S1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC183Q5T5S1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC183Q5T5S1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC183Q5T5S1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC183Q5T5S1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC183Q5T5S1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC183Q5T5S1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC183Q5T5S1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC183Q5T5S1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC183Q5T5S1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC183Q5T5S1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC183Q5T5S1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC183Q5T5S1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC183Q5T5S1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC183Q5T5S1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC183Q5T5S1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC183Q5T5S1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC183Q5T5S1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC183Q5T5S1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC183Q5T5S1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC183Q5T5S1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC183Q5T5S1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC183Q5T5S1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC183Q5T5S1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC183Q5T5S1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC183Q5T5S1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC183Q5T5S1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC183Q5T5S1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC183Q5T5S1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC183Q5T5S1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC183Q5T5S1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC183Q5T5S1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC183Q5T5S1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC183Q5T5S1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC183Q5T5S1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC183Q5T5S1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC183Q5T5S1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC183Q5T5S1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC183Q5T5S1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC183Q5T5S1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC183Q5T5S1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC183Q5T5S1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC183Q5T5S1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC183Q5T5S1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC183Q5T5S1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC183Q5T5S1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC183Q5T5S1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC183Q5T5S1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC183Q5T5S1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC183Q5T5S1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms