Protein–RNA interactions for Protein: Q5T160

RARS2, Probable arginine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARS2Q5T160 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RARS2Q5T160 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RARS2Q5T160 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RARS2Q5T160 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RARS2Q5T160 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RARS2Q5T160 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RARS2Q5T160 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RARS2Q5T160 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RARS2Q5T160 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RARS2Q5T160 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RARS2Q5T160 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RARS2Q5T160 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RARS2Q5T160 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RARS2Q5T160 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RARS2Q5T160 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RARS2Q5T160 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RARS2Q5T160 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RARS2Q5T160 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RARS2Q5T160 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RARS2Q5T160 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RARS2Q5T160 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RARS2Q5T160 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RARS2Q5T160 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RARS2Q5T160 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RARS2Q5T160 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RARS2Q5T160 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RARS2Q5T160 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RARS2Q5T160 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RARS2Q5T160 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RARS2Q5T160 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RARS2Q5T160 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RARS2Q5T160 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RARS2Q5T160 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RARS2Q5T160 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RARS2Q5T160 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RARS2Q5T160 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RARS2Q5T160 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RARS2Q5T160 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RARS2Q5T160 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RARS2Q5T160 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RARS2Q5T160 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RARS2Q5T160 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARS2Q5T160 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARS2Q5T160 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARS2Q5T160 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARS2Q5T160 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARS2Q5T160 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARS2Q5T160 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARS2Q5T160 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARS2Q5T160 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARS2Q5T160 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARS2Q5T160 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RARS2Q5T160 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RARS2Q5T160 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARS2Q5T160 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARS2Q5T160 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARS2Q5T160 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RARS2Q5T160 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms