Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COL5A1-AS1Q5SY13 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL5A1-AS1Q5SY13 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms