Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD3Q5JSP0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGD3Q5JSP0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms