Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP221Q4G0U5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP221Q4G0U5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP221Q4G0U5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP221Q4G0U5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP221Q4G0U5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP221Q4G0U5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP221Q4G0U5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP221Q4G0U5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP221Q4G0U5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP221Q4G0U5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP221Q4G0U5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP221Q4G0U5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP221Q4G0U5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP221Q4G0U5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP221Q4G0U5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP221Q4G0U5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP221Q4G0U5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP221Q4G0U5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP221Q4G0U5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP221Q4G0U5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP221Q4G0U5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP221Q4G0U5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP221Q4G0U5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP221Q4G0U5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP221Q4G0U5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP221Q4G0U5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP221Q4G0U5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP221Q4G0U5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP221Q4G0U5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP221Q4G0U5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP221Q4G0U5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP221Q4G0U5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CFAP221Q4G0U5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP221Q4G0U5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP221Q4G0U5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP221Q4G0U5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP221Q4G0U5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP221Q4G0U5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP221Q4G0U5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP221Q4G0U5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP221Q4G0U5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP221Q4G0U5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP221Q4G0U5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP221Q4G0U5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP221Q4G0U5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP221Q4G0U5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP221Q4G0U5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP221Q4G0U5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP221Q4G0U5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP221Q4G0U5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP221Q4G0U5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFAP221Q4G0U5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFAP221Q4G0U5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFAP221Q4G0U5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFAP221Q4G0U5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFAP221Q4G0U5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFAP221Q4G0U5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
CFAP221Q4G0U5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFAP221Q4G0U5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms