Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
RNF212Q495C1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RNF212Q495C1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms